真菌性腦膜炎患者基本不能痊愈，死亡率較高。真菌性腦膜炎是一種非常嚴重的腦膜炎，由隱球菌、毛霉菌及曲霉菌等真菌感染導致，病灶位置常與腦部相連，鼻腔、鼻竇、眼眶等位置常具有明確的病灶。如果疾病早期沒有發現病灶，未進行及時處理，患者可能出現顱內感染，治療難度較大。毛霉菌和曲霉菌患者的死亡率為100%，隱球菌患者死亡率為90%，死亡率較高。