泌尿系結石對泌尿系產生梗阻，造成排尿不通暢，甚至排尿困難。嚴重的腎結石可能破壞腎臟功能，甚至引發腎功能減退和腎功能衰竭。臨床上部分患者，尤其是出現雙腎結石或雙輸尿管結石的患者可能產生急性腎功能衰竭，需要進行急性的透析進行救治。泌尿系結石引起的梗阻最大的危害是尿毒癥，甚至可以導致患者死亡。另外，泌尿系結石患者可產生疼痛，如腎絞痛，給患者帶來巨大痛苦。泌尿系結石可引起血尿，如果病情嚴重可能因為出血而造成休克，危害生命。