結腸鏡是腸鏡的一種檢查方式，結腸鏡主要用于檢查整個結腸、直腸、肛管的情況，當然也可以看到盲腸末端，大約10-20cm的距離，而腸鏡包含小腸鏡、膠囊內鏡等。因此結腸鏡只是腸鏡的主要的分支。 從狹義上，腸鏡指結腸鏡，從廣義上，腸鏡還包含小腸鏡和膠囊內鏡。膠囊內鏡是一種和藥丸一樣的鏡頭，在病人吞下之后會隨著腸子的蠕動逐漸向肛門方向移動，膠囊內鏡隨著蠕動就將會經過的每個地方看到的影像錄制下來，最后醫師可以根據影像判斷是否發生疾病，以及疾病的部位。但是膠囊內鏡存在缺點，由于是被動進行運動，隨著腸蠕動而蠕動，因此無法全方位360°觀察腸管，有的地方會遺漏而出現漏診的情況，并且也不能夠進行活檢，只能進行觀察。