腸鏡和肛門鏡均為肛腸科常見的檢查方式，常見區別如下：1、腸鏡：是全結腸的檢查方法，是長度在1.3-1.6m的窺鏡，從肛門進入后循著腸腔逐漸回到盲部，即整個直腸、結腸，通過腸鏡檢查都可以觀察到。通過腸鏡檢查需要排除腸道的器質性改變，比如腫瘤、息肉，或者炎癥性疾病以及積食等疾病；2、肛門鏡：是比較簡易的肛腸科檢查手段，隨時都可以做。通過肛門鏡檢查，可以看到直腸中下段到肛門位置上的直腸和肛管情況，可以觀察到直腸下段是否是有占位性改變、炎癥性改變，是否有異物，以及結構性改變。肛門口位置是否存在肛裂、痔瘡、息肉，肛乳頭是否存在肥大、炎癥、感染。外觀能觀察到的表現通過肛門鏡都能觀察到，即肛門鏡檢查比較簡單、方便，不需要做特殊腸道準備，隨時可以進行檢查。對于肛腸科每個首診的肛腸病人都需要進行肛門鏡檢查，而懷疑存在腸道病變的病人需要進行腸鏡檢查。現在腸鏡的適應癥范圍已經較寬，如果有不能明確診斷的腸道問題，可以進行腸鏡檢查以排除惡性疾病。