MRI檢查的禁忌癥是為確保檢查的安全性，分為絕對禁忌癥和相對禁忌癥。即不能做的檢查，絕對不允許做，可以做的檢查要在安全操作下進行。絕對禁忌癥包括電子設備、鐵磁性設備、患者高熱等，如心臟起搏器、胰島素泵、鐵磁性動脈瘤、眼內的鐵磁性金屬異物；相對禁忌癥包括非鐵磁性或弱鐵磁性的金屬植入物、假牙、避孕環、危重患者、不能配合的兒童和聾啞患者。