正常人的糞便中含有大量的細菌，糞便標本的檢驗必須是在混有大量正常菌的菌群中選出病原菌。大便培養檢查項目如下： 1、一般的細菌培養，大便培養及鑒定通常需要48小時，常規檢測的病原菌，包括沙門菌、志賀菌、彎曲菌，濱海城市的實驗室，還應該檢查氣單胞菌和弧菌，血性糞便注意分離O157。除以上細菌外，通過大便培養可以分離到的病原菌，還有小腸耶爾森氏菌、鄰單胞菌、致病性大腸桿菌，遲緩愛德華菌、蠟樣芽孢桿菌、艱難梭菌、葡萄球菌、產酸克雷伯菌等； 2、可以查到真菌的培養，少量的真菌孢子在大便內存在，但是真菌性的腹瀉多繼發于抗生素治療以后的菌群失調，多為白色念珠菌； 3、藥敏試驗，如志賀菌屬、沙門菌屬、氣單胞菌屬、鄰單胞菌屬、弧菌屬等，僅腸內感染時，報告氨芐西林、甲氧芐氨嘧啶、磺胺甲惡唑和喹諾酮類的藥物藥敏結果，有侵襲性感染的病人存在多重耐藥菌株時，同時報告第三代頭孢菌素的藥敏結果，霍亂弧菌同時應報告多西環素或者四環素類。