胃間質瘤過去叫交界性腫瘤，介于胃的良性和惡性腫瘤之間，現在叫胃腸道惡性間質瘤，是個惡性疾病，只是惡性程度相對胃癌、淋巴瘤，可能進展更緩慢，多數患者預后還是比較好的。大部分患者早期癥狀都不明顯。 如果腫瘤≥5cm，有可能會引起部分壓迫癥狀，病人可能會覺得腹脹、腹部不適，或者餐后有飽脹感。如果腫瘤≥10cm，可能會壓迫其它臟器，產生相關癥狀，比如壓迫到腸管，患者可能有脹氣、惡心、不適。所以癥狀主要與腫瘤的體積大小直接相關。另外此類腫瘤有個特點，因為長在胃的間質里，長到一定大小的時候有可能會造成胃黏膜的撕裂，腫瘤表面有黏膜面的臍樣潰瘍，甚至有可能出血。一旦合并有出血，患者可能會有黑便，大量出血時可能會有嘔血。 所以，胃腸道惡性間質瘤的主要癥狀是出血和腫瘤較大時的壓迫癥狀。