腎結石腰痛的原因，要了解結石產生腰痛的過程，結石產生腰痛必須有梗阻。所以對于腎臟下盞的小結石，比如5mm，甚至1cm的結石，不產生局部腎臟腎下盞的積水，理論上不會痛。疼痛可能是在某個時間段活動時，因為結石在腎臟里會到處跑，通常跑到最低的位置是腎臟下盞。但是如果某個時間跑到輸尿管腎臟連接部的地方，也稱為PUJ的地方，就是腎盂輸尿管連接部的地方，這個位置是整個腎臟尿液的總出口。一旦總出口堵上之后，哪怕4mm結石、3mm結石，只要總出口堵住，引起腎臟積水增加，就會造成腎絞痛、腰痛的情況發生。