椎管內麻醉作為有創操作，需對背部皮膚進行穿刺，通過穿刺針或導管將局部麻醉藥注入蛛網膜下腔或硬膜外腔。在脊髓表面的如上操作有著極大的細菌感染的風險，故背部癤腫或皮膚感染為椎管內麻醉的禁忌證。凝血功能障礙的患者采用椎管內麻醉可能會導致硬膜外腔的血腫，從而導致截癱等惡劣并發癥。宮外孕、失血過多、存在休克表現、嚴重高血壓、呼吸功能不全的患者亦不適合椎管內麻醉。