隱匿性陰莖需通過手術治療松解陰莖，將陰莖牽引出來，再將陰莖皮膚放回，進行加壓包扎。隱匿性陰莖最主要的治療方法是陰莖矯正延長手術，而不是單純的切除包皮。由于大部分家長不了解隱匿性陰莖，認為孩子的包皮過長，可以等到長大后再做手術，但是對于較嚴重且合并有包莖的情況，要及早到醫院進行手術，一般建議在患者發育之前，即8-12歲進行手術治療，恢復情況較好。