機體碘缺乏，最常見的就是地方性甲狀腺腫伴甲狀腺功能減退癥，這是由于這些地區遠離海邊，食物中含有的碘成分較少，而碘又是合成甲狀腺激素的主要原料，如果碘缺乏就可能會導致甲狀腺代償性的增大，而甲狀腺代償性的增大超過一定標準，就可以產生甲狀腺的腫大，即大脖子病。現在這種情況已經很少見，因為現在的鹽一般都有碘劑，不會造成碘缺乏，發生碘缺乏時，甲狀腺激素合成分泌減少，需要查甲狀腺激素的水平，如果甲狀腺腫大，又伴有甲狀腺功能減退癥，那么有可能是碘缺乏導致的甲狀腺功能減退癥，應給予左甲狀腺激素替代治療。機體內的碘絕大多數都是由甲狀腺上皮細胞所攝取，在甲狀腺細胞內進行碘化絡氨酸，所以機體如果缺碘，主要是對甲狀腺激素的合成產生影響，對其他的臟器一般不會產生影響，甲狀腺激素的合成主要是在甲狀腺內進行，所以當碘缺乏時，甲狀腺組織就會代償性增大，造成甲狀腺組織的腫大。