小兒完全性肺靜脈異位引流是較兇險的疾病，特別是梗阻性的完全性肺靜脈畸形引流，一般采取早期手術治療，目的是恢復肺靜脈與左心房的正常連接。心下型的肺動脈畸形引流出現梗阻幾率較大，尤其在下靜脈穿隔、入肝的部位，由此手術風險較大，無論是肺靜脈畸形引流或完全性肺靜脈畸形引流發現后均需早期治療，特別是肺靜脈梗阻的患者，如不早期治療，可能會夭折、死亡。