食管腫瘤分為良性和惡性，良性腫瘤的病因如食管的平滑肌瘤，與肌肉的瘤樣變有關。惡性腫瘤如食管癌的病因主要有吸煙、飲酒、長期食用過燙的食物、缺乏維生素及遺傳因素等。吸煙、飲酒及過燙的食物均可損傷食管黏膜，維生素缺乏可使食管黏膜的修復能力下降。這些病因導致食管黏膜的慢性損傷和反復修復，在反復修復的過程中，細胞轉變為癌細胞。