精子畸形率高達99%并不意味精子頭部存在缺陷，也無法確定該患者能否正常使配偶懷孕，因此患者切勿恐慌。若其備孕時間較短，應嘗試正常懷孕，若能正常懷孕，則表明精子具有正常的受孕能力；如正常備孕一年的情況下仍無法懷孕，則應采取相應的治療措施，如改變生活、工作的方式、藥物治療等。另外，當患者精子頭部的畸形率為100%時，此時無法正常懷孕的機率較大，可能需依靠試管嬰兒手段懷孕。