肺動靜脈瘺大多數發生在肺部的一葉或一段，可以通過微創胸腔鏡發現異常的動脈和靜脈，即造成瘺的動脈和靜脈，通過手術把病變切除。一般只需切除病變肺段，無需做肺葉的切除。若把動脈和靜脈的瘺切除掉，則不會存在動脈到靜脈的短路，可以改善心臟功能，即可治愈先天性肺動靜脈瘺。若整個肺葉存在嚴重的肺動靜脈瘺，則可能造成心功能影響，如右心衰竭等。