針灸操作較為嚴格，操作前會對診室進行嚴格消毒，操作過程中通常選用75%的乙醇對醫師手指及患者針刺部位進行消毒，一般選用一次性無菌針灸針，且不會重復使用。部分材質特殊的針灸針可能涉及到反復利用，但使用之前會采取一定的消毒措施。同時，治療之前會詳細詢問患者病史，若其患有傳染疾病，則可能避免使用針灸治療。因此，針灸治療十分安全，不會得傳染病。