無痛胃鏡的檢查時間與普通胃鏡相同，只是無痛胃鏡需要麻醉。通常檢查時間是10-15分鐘，但是一定要將食管、十二指腸均觀察清楚，每一個典型部位均需要留圖，可疑部位則需要病理活檢，為快速尿素酶試驗取材。因此根據上述要求，最少需要7分鐘，10-15分鐘比較好，但是過長時間會延長病人的痛苦。無痛胃鏡在操作之前需要靜脈注射麻醉藥，使病人處于麻醉狀態，而且沒有惡心反應，醫生操作更加從容，注入氣體能夠很快將胃撐開，所以觀察更快、更安全。因為胃腔、食管腔粗大，鏡子＜1cm，在直視下邊進鏡、邊觀察，通常在有經驗的醫生操作下不會發生穿孔等意外。