無痛胃鏡檢查并不難受，與麻醉劑量有關。無痛即沒有感覺，患者處于睡眠狀態，因此患者不必擔心。另外，部分患者認為進行胃鏡檢查后記憶力會逐漸下降，但人的記憶隨年齡增長本來就會逐漸下降，因此患者不能將記憶下降歸咎于無痛胃鏡檢查。 無痛胃鏡整個操作過程約需五分鐘，除非出現麻醉意外，否則出現不適的概率非常小。因此進行胃鏡檢查的患者并無明顯不適，多數患者感受良好。并且患者可能在檢查前十分緊張，而檢查后反而能幫助睡眠。