非結核分枝桿菌肺病又稱NTM肺病，對于該病目前醫學上尚無明確、標準的化療方案。因多數肺結核分枝桿菌肺病對結核病藥物具有耐藥性，導致治療NTM肺病用藥均需3-5種藥，所以其治療較肺結核病難，治療周期較結核病長，一般難以治愈。建議患者長期服藥，定期監測藥物不良反應，以及每月定期痰檢。NTM肺病痰培養陰性后，還需堅持鞏固治療1年以上。