大多數病毒感染是自限性的疾病，加上抗病毒藥有毒副作用，所以一般不需要特殊抗病毒治療，幾天以后自然病情好轉。少數病毒感染有些特效藥，需要特效藥物減輕癥狀，比如： 1、流感感染可以用奧司他韋、扎那米韋治療，可以縮短熱程，減緩流感嚴重病例的出現； 2、皰疹病毒感染，尤其是皰疹病毒腦炎，應極早期應用阿昔洛韋，可以明顯降低死亡率，減少神經系統后遺癥發生率； 3、CMV病毒，如果活動的CMV病毒也就是巨細胞病毒感染，可以用更昔洛韋治療，縮短病程、減輕后遺癥發生； 4、有些病毒比如肝炎病毒可以用干擾素治療，流感也可以用干擾素治療； 5、利巴韋林噴劑可以治療呼吸道合胞病毒感染； 只在某些少數的病毒感染情況下需要抗病毒治療，絕大多數病毒感染自限，自己能痊愈，不需要額外抗病毒治療，針對當時癥狀給予對癥治療。