女性在服用抗病毒藥物的情況下應盡量避免妊娠，因為多數抗病毒藥物在被懷孕的女性服用后會對胎兒發育造成影響。抗病毒藥物可導致胎兒的神經系統、心血管系統以及骨骼發育畸形，所以建議備孕期的女性以及孕婦避免服用抗病毒藥物。抗病毒藥物的種類較多，如針對乙肝進行抗病毒治療的常用藥物，包括干擾素、恩替卡韋、替諾福韋以及丙酚替諾福韋。其中干擾素可以影響胎兒的發育，而恩替卡韋的動物試驗發現會引起動物胚胎的發育畸形，均不可用于進行備孕或懷孕中的乙肝患者。若女性在備孕或懷孕期間需要進行抗病毒治療，則可以選擇副作用較小的抗病毒藥物，如替諾福韋酯、丙酚替諾福韋酯或富馬酸替諾福韋酯進行治療。