做穿刺由于是有創操作，仍然會對身體的穿刺部位造成物理損傷，而且穿刺部位的不同也有一定的不同風險。穿刺在臨床中是比較常用的診斷和治療手段，比如當出現腹腔積液時可通過穿刺來明確腹腔積液的性質，并送化驗室判斷其初步的來源。如果是實體腫物，比如乳腺、甲狀腺等可疑惡性腫物均可通過穿刺活檢的方式來明確其性質。由于穿刺是用穿刺針來進行，在穿刺的這條隧道上容易造成細小的損傷，盡管損傷的創面相對較小，但一旦觸碰到特殊的神經、血管仍然有明顯的并發癥出現，尤其是血腫的出現。如果是腹部穿刺，一旦下方有擴張的腸管還容易造成腸瘺等嚴重的外科急腹癥的情況。在進行穿刺時由于還要注射麻醉藥物，也有一定的麻藥過敏和穿刺點感染的可能。