肛周膿腫根治性切除術后大約4-6周愈合，具體愈合時間與膿腫部位、大小及患者體質有關。該病由于肛門腺腺體感染引起，治療肛周膿腫過程中，須盡快尋找膿腫來源，進行根治性膿腫切除。肛周膿腫根治性手術后，因切口不能縫合，恢復期比其它部位感染長，大約為4-6周。如果患者患有糖尿病，愈合時間可延長；年老體弱、營養較差也可影響切口愈合時間。如果肛周膿腫未進行根治性切除，后期可能還需進行肛瘺手術，難以確定愈合時間。