胃食管反流病可以手術治療，適用于嚴重的胃食管反流病，即B級以上或合并嚴重并發癥，如食管癌前病變、巴雷特食管、食管裂孔疝，以及長期服藥不改善者，可以采取手術治療。臨床多采取微創腹腔鏡手術治療，手術安全有效，是歐美國家治療胃食管反流病的金標準，隨著胃食管反流病的發病率逐年增高，手術開展也越來越多。若病情較輕，也可選擇保守藥物治療，如奧美拉唑等PPI制劑。