胃食管反流的嚴重程度應根據不同情況具體分析。大部分患者可能會有生理性反流，即當飲酒、吃辛辣刺激性食物時，可能發生一過性反流，稱為生理性胃食管反流。嚴重的胃食管反流性疾病也不罕見，患者通常表現為嚴重的反酸、燒心、夜間無法平臥睡眠，感覺酸水反入喉嚨中，甚至可能反流入氣管、引起嗆咳，部分患者因為嚴重反流可造成窒息，甚至達到搶救的嚴重程度。此外，由于長期胃食管反流，部分患者可能發生反流性食道炎，即食道下端黏膜糜爛與充血，嚴重時可能導致潰瘍。反復瘢痕、潰瘍時部分患者可能形成食管下端狹窄，出現吞咽困難，所以不可以低估胃食管反流性疾病。還有部分患者由于常年胃酸反流，導致食管下端的黏膜病變，稱為巴雷特食管，部分巴雷特食管為食管癌的癌前病變，所以患者若發現胃食管反流，需進行積極治療。