克羅恩病的癥狀主要是腹痛，還可能出現腸梗阻、腸瘺，腸瘺是腸皮瘺、腸間瘺，還有些病人，特別是年輕人，可能找不到原因，體重消瘦，大便不成形，到醫院來發現腸道長了潰瘍，經過反復的專家會診，發現可能是克羅恩病。但還有一部分病人誤診，可能因為腹痛，右下腹的疼痛在當地醫院就診，可能是被診斷為闌尾炎，但是做了闌尾炎手術之后，病人的傷口反復的長不好，形成一個瘺管，再給病人進行腸鏡，可能就懷疑是克羅恩病。克羅恩病的一些癥狀是比較隱匿的，但是很容易出現腸瘺或者腸梗阻的并發癥，而因為這些并發癥可能需要接受外科手術的治療。