瘧疾的早期癥狀不典型且不存在特異性，可以表現為頭疼、頭暈、乏力、食欲不振以及嗜睡等非特異性癥狀。而瘧疾的臨床特征是寒戰、高熱、出汗熱退，癥狀呈周期性發作。瘧疾的病程可分為寒戰期、發熱期及出汗期，寒戰期表現為突發的寒戰，初期出現四肢發冷隨后出現全身發冷，持續時間在1小時左右。隨后進入發熱期，患者的體溫迅速上升，可以伴有頭疼等反應。發熱期持續4-8小時后進入出汗期，病人大汗隨后體溫恢復正常，持續時間為0.5-1小時。間歇期的病人不會出現癥狀，也可能存在乏力以及食欲不振。對于上述周期的時間間隔根據瘧原蟲的種類而有所不同，如間日瘧為間日發作，三日瘧則為三天發作一次，而惡性瘧的發作并不存在規律。