肛周膿腫手術麻醉方式需根據病人身體條件和手術方式決定。簡單的切開引流完全沒必要選擇全麻。如位置比較低也可以不做全麻，局部麻醉也可做到，深部的膿腫至少選擇腰麻或全麻。本身膿腫病人比較疼痛，術中再探查膿腔做進一步掛線，病人會比較疼痛。 所以如果手術范圍較大做全麻比較好，而且對術后恢復更好一些。但選擇麻醉方式也與病人身體條件和對疼痛耐受程度有關。有些病人對疼痛不耐受，小的手術可以選擇全麻，病人比較舒適，術后痛苦較少。