腦干區域一直被神經外科列為手術禁區，不能去碰它。其原因為腦干是人體呼吸、循環的中樞。如果一旦被侵犯，患者會出現呼吸和循環的變化。但是近十幾年隨著顯微技術的高速發展，國內已經有很多醫院在腦干的病變方面做出了很多事情，使腦干手術得到了較大的發展。所以腦干出血患者，可以根據其出血量和出血部位，合理選擇手術方式。具體手術方式包括定向穿刺引流、顯微鏡下血腫清除、神經內鏡下血腫清除，這些都是治療腦干出血的方法。