腦干出血造成的功能損傷包括了生命體征不穩定、呼吸功能不好，呼吸可能會停止或者微弱，在這樣前提下所有的損傷大的或者要求麻醉配合高的手術已經不適合了。 腦干出血大部分采取穿刺手術，腦室穿刺引流腦積液緩解顱內高壓，和在立體定向精準的定位下進行血腫穿刺，患者必須是生命體征平穩的前提下才能有這樣的手術時機。對于部分出血原因未明的腦干出血，上述兩種方法只是針對血腫清除或腦積液引流，而沒能進行病因的治療，這部分病人有可能會二次出血。