肛門鏡檢查的適應癥比較廣泛，只要出現肛門直腸疼痛的疾病的時候，都可以進行肛門鏡檢查，比如痔、瘺、便血、直腸脫垂等都可以進行；在直腸下段病變需要進行活體組織檢查的時候，也可以進行肛門鏡檢查。所謂活體組織檢查就是取一部分的組織來進行檢查。肛門檢鏡檢查的禁忌癥：1、肛門直腸有狹窄的；2、肛門和直腸有急性感染或者劇烈疼痛者，比如肛裂、膿腫，這個時候進行檢查就會給病人帶來極大的痛苦，所以這個時候一般不進行檢查；3、當懷疑直腸有穿孔或者有嚴重精神性疾病不能耐受檢查的；4、在婦女月經期，一般也不推薦做肛門鏡的檢查。