小孩病毒性腦膜炎一般都不嚴重，但毒力比較強的病毒感染比較嚴重。比如單純皰疹病毒感染的死亡率比較高，后遺癥發生率也很高，即使治療比較及時，也可能會出現后遺癥，相對比較難治療，類似這種病毒性腦膜炎比較嚴重。其它普通的腸道病毒，還有普通的病毒感染，如果治療及時，預后尚可。現在的醫療技術水平越來越好，一般病毒性腦膜炎不算太嚴重。但是單純皰疹病毒或者是EB病毒、腺病毒、水痘-帶狀皰疹病毒、手足口病病毒感染相對比較嚴重。手足口病病毒感染引起的腦膜炎，通常會影響生命呼吸中樞，要到醫療條件比較好的醫院才會沒有生命危險，相對后遺癥發生率也不算太高。