急性結腸炎一般是感染性的病變，在中醫的證型中屬于寒濕或濕熱內攻造成的，通過常規的中醫中藥祛濕、解毒或中西醫結合的治療方法可以得到有效的治療。慢性結腸炎的病變則較為復雜，一般常見的慢性結腸炎主要是自身免疫性的結腸炎，即炎癥性腸病，包括潰瘍性結腸炎、克羅恩病等，這些疾病的病程較長，治療較難，臨床癥狀易反復，在治療的過程中有效的藥物也較少，此時中醫中藥可作為一種重要的治療手段，也可選擇西藥或中西醫結合的方法治療。