臨床輕度肛周膿腫或病情早期疼痛較輕，未出現紅、腫、熱、痛或發燒癥狀時，可通過口服消炎藥，可局部進行中藥坐浴或外涂消腫藥膏改善。如果在病情早期進行干預，保守方法即可治愈肛周膿腫。但對進展較快或膿腫較大患者，不建議采取保守療法，可能會耽誤病情，錯失手術時機，對疾病預后不利。若為特殊患者，如合并血液病、年高體弱、嚴重心臟病或心腦血管疾病等，患者出現肛周膿腫無法耐受手術，也可采取保守療法。若患者有膿液需穿刺引流，將膿液抽出后，再進行消炎治療，較單純輸液消炎效果好。如果膿腫較深，穿刺不方便，可切開接個管進行沖洗，也屬保守療法，但僅可暫時緩解。臨床所有肛周膿腫患者采取保守治療均為權宜之計，多數肛周膿腫患者需手術根治，否則肛周膿腫可形成肛瘺。患者形成肛瘺也不用擔心，部分患者不適合手術時，也可待肛周膿腫形成肛瘺后再擇期手術。