體外沖擊波碎石是現在在所有的結石治療中，除了保守治療外副作用最小的，但是也不是說完全沒有副作用。體外碎石必須要嚴格的按照操作流程、操作規范去操作。比如說石頭很硬，不能今天碎了明天碎。在臨床上正確的是一般是相隔兩個禮拜才能碎第二次。如果碎了三次，還是沒有什么任何作用，就不建議再碎第四次。體外沖擊波碎石，對腎也是有損傷的，之前也有出現做了體外碎石之后，整個腎的功能都喪失了。這是因為操作不規范，或者是說體外沖擊波碎石太過頻繁引起的。