ERCP是一個非常安全的手術，但是也有一定的并發癥發生率，最常見的是急性胰腺炎，發生率大概在5%左右，高的可以達到10%。部分人群容易發生ERCP術后胰腺炎，比如年輕人，年紀越輕，ERCP手術后發生胰腺炎的可能性就越大；另外，女性比男性更容易發生胰腺炎；如果患者本身有胰腺炎病史，在這種情況下ERCP術后也容易發生胰腺炎。大部分病人都是輕型胰腺炎，治療起來比較容易，不會遺留任何后遺癥，胰腺恢復之后，可完全恢復到正常的狀態，僅有極少數人會出現重癥胰腺炎。目前導致ERCP術后胰腺炎的機制還不是特別清楚，可能與在胰腺的操作有關系，比如十二指腸乳頭部位受到器械的觸碰，可能引起乳頭開口水腫，胰液流不出來，引發胰腺炎。這是一個可能的機制，還有待進一步研究。