腹瀉在胰腺炎初期較少見，一般多見于治療過程中或恢復期。同時在住院過程中可考慮腸道菌群失調，如抗生素使用較多引起抗生素相關性腹瀉，或大量抗生素使用導致偽膜性腸炎引起腹瀉。若為抗生素相關性腹瀉，需補充益生菌、調整抗生素使用。如果為偽膜性腸炎引起的腹瀉，需應用萬古霉素或甲硝唑對癥治療。若在恢復期時病人出現腹瀉，主要考慮腸道菌群問題，可用收斂藥物或中藥調理，同時補充腸道益生菌，效果較好。