最常見的肛周膿腫手術稱之為切開引流術，就相當于人體出現一個癤子，將之劃破后，將膿放出一樣。但是肛周膿腫的位置與人體其它部位不一樣，肛周膿腫的形成主要因肛竇炎感染，因此進行手術時，不但要把膿腔切開，同時一定要把膿腔刮干凈，然后通過引流讓創口慢慢愈合，此為肛周膿腫最常見的手術。目前而言，肛周膿腫與肛瘺有直接關系，那么一次性把肛周膿腫與肛瘺的內口全部找到，做一次性的根治術，會防止病人術后需要進行二次手術，因為經切開引流術治療，30%的患者可以治愈，70%的患者有可能會形成肛瘺，可能需要二次手術治療。因肛周手術的切口是感染性切口，所以術后需通過外用藥物治療、抗炎，然后通過外用藥物清洗，以減輕感染區域。沖洗之后，要求病人控制飲食，忌食辛辣食物，防止出現便秘。患者每次大便后應坐浴清洗，以促進傷口愈合。