一般來講，肛瘺會導致排便困難。按照瘺管位置的高低，可以將肛瘺分為低位肛瘺和高位肛瘺。當肛瘺的外口愈合，瘺管中有膿腫形成的時候，可以明顯的感到疼痛，這會導致排便困難，有阻礙。復雜性肛瘺，瘺口經久不愈可以引起肛管、直腸周圍形成大的纖維化瘢痕或者環狀條索，也會影響肛門的舒張和閉合，會感到排便困難，有排便不盡的感覺。遇到這種情況不要害怕排便疼痛，或者排便困難就不去排便。在日常生活中一定要養成定時排便的習慣，防止便秘。要注意生活習慣，不要吃辛辣食物，禁忌煙酒，多吃富含維生素的蔬菜和水果。如果排便困難嚴重，可以手術治療，手術方式主要是瘺管的切開、切除、掛線療法和肛瘺切除術等，根據病情的不同，選擇合適的治療方法。