肛隱窩炎產生排便困難的主要因素是局部炎癥和纖維化。由于肛隱窩存在于齒狀線，下方是內括約肌，若發炎往往會導致內括約肌的痙攣。內括約肌痙攣可以使肛門變緊，排便時可以更加費力。 通常大便干燥時癥狀尤為明顯，特別是初次前段排便完以后，肛隱窩發炎引起肌肉痙攣會加重，后段糞便排出更加困難。所以肛隱窩發炎可以產生排便困難，主要表現為后段糞便排便困難。特別是長期發炎以后使肛周纖維組織增生，失去彈性，這時排便更加困難。因此，引起肛隱窩炎產生排便困難的主要因素是局部炎癥和纖維化。