頭顱CT平掃最大的危害是輻射。CT檢查有一定輻射量，但顱腦CT平掃能解決很多問題，假如頭部外傷病人不知道顱內情況怎么樣，這時做頭顱CT，雖然有一定輻射，但可判斷顱內有沒有病變，如出血、骨折等改變，相對于輻射可能會產生更大效益。 輻射和本身疾病會不會產生生命危害比較，就是一種比較小的傷害，這時頭顱CT檢查比較合適，所以頭顱CT除輻射外，沒有一般傷害。當患者出現外傷或者懷疑腦出血時，做頭顱CT平掃有很大好處，對病變評判、下一步治療選擇都有很大價值，所以頭顱CT平掃除輻射外沒有其它危害。