心律失常發生在漂浮導管置入過程中，是比較常見的。因為導管的尖端有可能刺激到心內膜，誘發心律失常。常見的是室上性的心動過速或者室性的早搏，都可以通過使用利多卡因抗心律失常的藥物來治療。但是，一旦出現惡性的心律失常，如室顫或者是室性的心動過速，要立刻拔出漂浮導管，并且進行心肺復蘇的搶救。所以，在操作中必須有心電的持續監護，發現病人出現心律失常，就要盡快的進行搶救，推注抗心律失常的藥物。原有心肌疾病的患者，可以提前預服硝酸甘油或者是注射利多卡因，來預防心律失常的發生。