高位肛瘺，一般病史比較長，肛瘺的位置比較深，涉及的范圍也比較廣，有時有多個肛瘺外口。高位肛瘺唯一根治手段就是外科手術，手術方法有兩種，包括肛瘺瘺管切除術和高位肛瘺掛線術。手術過程之中，要把肛瘺的瘺管清除，找到肛瘺內口，清除炎性病灶，保持傷口引流通暢。手術過程之中，避免損傷內括約肌，盡量使傷口減少損傷，可留置皮橋，注意術后換藥和術后護理，以及患者的營養均衡，促進傷口盡快愈合，使患者盡快恢復正常生活。