甲狀腺淋巴結轉移主要靠手術治療。因為甲狀腺癌可根治，如果早期發現，可僅做一側腺葉和峽部，還需做預防性的六區清掃，即中央淋巴結清掃。如果發現較晚，有頸部淋巴結轉移時，需做頸清掃，包括側頸清掃、功能性頸清掃及根治性頸清掃。根據不同的甲狀腺癌分期，清掃范圍不同。其唯一的目的是將頸部可能轉移的淋巴結全部清掃，以提高患者后期的生存率，且術后不必進行其它治療，包括同位素治療或放射治療，以減輕對患者二次治療的損害。如果淋巴結轉移與動靜脈關系比較密切，手術無法切干凈，則可通過放射治療、同位素治療，將殘余淋巴結或未切干凈的淋巴結消除。