系統性紅斑狼瘡是個體之間很難比較的疾病，即部分孩子表現很重，部分孩子很輕。治療紅斑狼瘡首先要區分疾病的嚴重性，還要非常明確患兒狼瘡影響到哪些臟器，以及臟器受累的嚴重程度。如果是輕度狼瘡，通常只要使用很小劑量的激素，比如每公斤0.2mg加羥氯喹，加上甲氨蝶呤，就能夠得到很好的控制。如果是較重的狼瘡，比如有血液系統明顯受累，有大量蛋白尿或明顯血尿，可能要用到大劑量激素加上免疫抑制劑。如果是特別嚴重的情況，比如腎功能已經出現異常，或者有溶血危象的出現，就需要給予大劑量激素沖擊，再加上免疫抑制劑治療。極個別孩子會出現危及生命的情況，比如心臟、肺，包括神經系統疾病的出現，可能就需要生命支持，讓孩子渡過難關后，再重新用大劑量激素沖擊，或者加上免疫抑制劑治療。總體而言，狼瘡的治療需分層，病輕者用較輕的治療方法，嚴重者需按照嚴重的治療方法調理。