子宮內膜異位癥最主要的癥狀是痛經，而且痛經是進行性加重。痛經可能經過休息、臥床都不能緩解，需要口服止痛藥物治療。部分患者甚至口服藥物都沒有效果，需要到醫院打止痛針。臨床上也見過很多止痛藥物都沒有效果的，需要多種止痛藥聯合使用。這些是屬于比較嚴重的子宮內膜異位癥。除了痛經以外，部分病人因為異位的子宮內膜組織可能生長到卵巢、輸卵管、尿管、腸管等組織可能會引起盆腔包塊。有些病人是以發現盆腔包塊來就診。如果侵犯到腸管或者輸尿管等位置，可能會出現經期便血、尿血等癥狀。另外，因為子宮內膜異位癥會容易形成盆腔粘連，影響盆腔環境，很多病人會合并有不孕病史。子宮內膜異位癥的幾大重要的癥狀是進行性痛經、盆腔包塊，還有便血、尿血，盆腔包塊的壓迫癥狀以及不孕等，部分病人還會出現有同房或者性生活的疼痛癥狀，這些是子宮內膜異位癥的主要癥狀。