腎小管酸中毒，從病因分，分為原發性和繼發性兩種類型。原發性腎小管酸中毒，一般是基因變異，所以很難進行根治，長期針對腎小管酸中毒，高氯性代謝酸中毒，及低血鉀問題，要長期藥物維持處理。繼發性病因引起的腎小管酸中毒，尤其藥物等一些相關因素，脫離這些藥物，能夠得到長期緩解，或得到一定時間的緩解。在藥物服用這方面，要防治腎小管性酸中毒，尤其原發性疾病，因為長期藥物治療，病因無法進行根治，所以出現腎結石，包括繼發性甲狀旁腺功能亢進這類疾病，要進行干預。包括結石，如果結石較大則需要進行處理，取石。對繼發性的，干燥綜合征或重金屬類治療后，通過原發病控制，脫離重金屬環境，進行處理后，病情可得到完全緩解。因此不管是原發性還是繼發性，如果是原發性，只要堅持長時間服藥，控制原發病帶來的并發癥。像腎性骨病、腎結石，能夠得到長期緩解。對于繼發性的，只要把病因進一步控制，能夠得到緩解，長期預后比較樂觀。