三叉神經痛手術最主要的并發癥包括聽力減退、面部感覺減退，甚至有些會出現嘴角歪斜等面癱癥狀，還會影響咀嚼運動。所以在三叉神經微血管減壓的手術過程當中，會要求進行咀嚼肌的電生理監測，怕術后影響患者的咀嚼運動。但隨著神經外科顯微技術的提高，并發癥的發生率逐步減小，現在發生率基本上很低，聽力減退雖然較難恢復，但聽力減退的發生率基本上在1%之內。除了聽力減退這個并發癥較難恢復以外，大多數如上所說面肌痙攣、面部抽動、面部感覺減退、咀嚼肌運動減退等癥狀都比較輕微，而且術后基本在一個月左右的時間就可以逐步恢復，大部分不會留下長久的并發癥，都為暫時性質。三叉神經和面聽神經挨得比較近，所以手術過程中會騷擾到面聽神經，所以其產生的并發癥主要是聽力減退和面部感覺減退以及面癱等情況。