該問題即腦起搏器的適應癥，現在被FDA批準的應用腦起搏器術治療的疾病包括帕金森病、震顫、肌張力障礙、癲癇等疾病。還包括以后的精神外科手術也可以采用腦起搏器治療，帕金森病可能多發于中老年病人，而震顫病人也以中老年為主。部分早發病人在20-30歲有一個高發期，而肌張力障礙的病人分為全身性肌張力障礙和局限性肌張力障礙。全身性肌張力障礙病人起病比較早，局限性肌張力障礙包括斜頸、梅杰綜合征等起病稍晚，還有癲癇病人等都適合腦起搏器的手術治療。