手術都會有風險，即使做闌尾手術醫生也會談到死亡的可能性。當然該手術死亡率很低，腦起搏器手術在神經外科是最小的即微創手術，當然該手術確實有風險，尤其病人如果超過70歲，手術風險會稍微增大。具體風險包括手術穿刺中出血，如果出血可能會引起偏癱、失語，但該幾率絕不會超過1%。由于要裝一個機子在身體里面，還會有排異、感染、導線斷裂、短路等機子本身的并發癥。還會有調試的并發癥，如出現麻木、說話問題、走路問題，但調試并發癥通過參數可以進行調節。總體來說腦起搏器是非常安全的有效治療運動障礙病的手術。